Proteomika: gigantikus közös vizsgálat indul
A UK Biobank bejelentése szerint 10 nagy gyógyszercég közösen indít egy nagy vizsgálatot az emberi szervezetben keringő mintegy 1500 plazmafehérje koncentrációjának meghatározására.
A UK Biobank december 7-én bejelentette, hogy 10 nagy gyógyszercég részvételével megalakult a Pharma Proteomics Project konzorcium, melynek célja egy olyan vizsgálat lefolytatása, ahol 53 ezer résztvevő szervezetében 1500 plazmaprotein koncentrációjának meghatározására kerül majd sor. A UK Biobank ehhez a hatalmas vállalkozáshoz 500 ezer ember azonosíthatatlanná tett genetikai adatait biztosítja a hozzá tartozó életmód- és kórtörténettel. A projekt során várhatóan eddig nem ismert összefüggések tárhatók fel egyes betegségek lefolyásáról, ami új, innovatív gyógyszerek fejlesztése előtt tárhatja ki a kaput. Mivel a betegek genetikai adatai is rendelkezésre állnak (értsd a teljes genom, lásd alábbi cikkünket: Egy sikeres brit genomikai program: a „Százezer Genom Projekt”), a kutatók jó eséllyel bukkanhatnak olyan DNS-hotspotokra, amelyek fontos szerepet játszanak különböző betegségekben, illetve olyan génvariánsokat, mutációkat is azonosíthatnak, amelyek különös jelentőséggel bírnak, például hajlamosító tényezőként szolgálnak.
A 10 fős konzorcium finanszírozásával induló projekt hivatalos plakátja
A vizsgálatot finanszírozó 10 cég közül 4 megtalálható a világ 10 legnagyobb forgalmú gyógyszervállalatának listáján (Johnson & Johnson, Pfizer, GlaxoSmithKline (GSK), Takeda Pharmaceutical), de a másik 6 is igen ismert név: Amgen, AstraZeneca, Biogen, Bristol Myers Squibb, Genentech és Regeneron. A laboratóriumi munkálatokat, méréseket egy svéd cég, a proteomika területén specialistának számító, Uppsala székhelyű Olink fogja végezni. A vállalat által kifejlesztett Olink® Explore 1536 platform kis mennyiségű mintákból is nagyon pontos fehérjeszintű adatokat szolgáltat nagy átmenő teljesítmény mellett. A tervek szerint az Olink pár hónap alatt 53 ezer résztvevőtől származó 56 ezer mintát vizsgál meg, ami 7,3 millió fehérjevizsgálatot jelent – a cég szerint ezt pár hónap alatt el is tudják végezni.
Az eredmények fel fognak kerülni a UK Biobank kutatóknak fenntartott felületére, és igaz ugyan, hogy 9 hónapig csak a finanszírozásban részt vevő cégek számára lesznek elérhetők, de az exkluzivitási időszak lejártával a teljes névtelenített adatbázis szabadon hozzáférhetővé válik a kutatási engedéllyel rendelkezők számára.
Következzen egy konkrét, nagyon aktuális felhasználási terület: azt már most tudni lehet, hogy a minták között különös hangsúllyal, legalább 1500 fős létszámmal fognak szerepelni olyan betegek adatai, akiknél COVID-19 fertőzést diagnosztizáltak, és akiken képalkotó vizsgálatokat is végeztek a betegséget megelőző és az azt követő időszakban (illetve legalább 1500 garantáltan negatív teszteredményű minta is elemzésre kerül majd). Ezeket az adatokat párosítva a proteomikus vizsgálatok eredményeivel, jobb betekintést kapunk a SARS-CoV-2 emberi szervezetre gyakorolt hatásairól, a fertőzésre adott patofiziológiai reakciókról.
Írásunk az alábbi közlemények alapján készült:
UK Biobank unveils studies to measure circulating protein concentrations
Proteomics study to investigate plasma proteins in 53,000 participants
